139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1398 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1343  phosphodiesterase  76.48 
 
 
517 aa  763    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0846  phosphodiesterase  64.64 
 
 
522 aa  650    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0502  phosphodiesterase  82.97 
 
 
517 aa  817    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1223  phosphodiesterase  76.48 
 
 
517 aa  763    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0520  phosphodiesterase  75.49 
 
 
517 aa  751    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1330  phosphodiesterase  79.64 
 
 
506 aa  820    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1398  phosphodiesterase  100 
 
 
506 aa  1001    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1309  phosphodiesterase  94.44 
 
 
505 aa  950    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0124805  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0884  YmdA/YtgF protein  74.9 
 
 
505 aa  750    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1214  phosphodiesterase  77.78 
 
 
517 aa  788    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  48.61 
 
 
515 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  46.99 
 
 
521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  47.87 
 
 
524 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  47.51 
 
 
518 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  45.47 
 
 
512 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  45.24 
 
 
508 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  45.44 
 
 
533 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.36 
 
 
522 aa  425  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  45.72 
 
 
520 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  46.87 
 
 
518 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  45.53 
 
 
533 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  44.62 
 
 
511 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  44.62 
 
 
511 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  47.02 
 
 
487 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.36 
 
 
518 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  44.67 
 
 
516 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  45.74 
 
 
520 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  45.74 
 
 
520 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  45.54 
 
 
521 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  45.74 
 
 
520 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  45.93 
 
 
520 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  49.43 
 
 
516 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  45.74 
 
 
520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  45.74 
 
 
520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  45.74 
 
 
520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  45.74 
 
 
520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.93 
 
 
516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  45.47 
 
 
521 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  45.16 
 
 
519 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  45.51 
 
 
521 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  45.24 
 
 
520 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  45.28 
 
 
520 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  45.81 
 
 
504 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  43.7 
 
 
521 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  45.88 
 
 
521 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  45.32 
 
 
511 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  53.05 
 
 
512 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.14 
 
 
520 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  45.35 
 
 
514 aa  402  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  43.97 
 
 
520 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  44.04 
 
 
531 aa  395  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  43.77 
 
 
519 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  43.95 
 
 
521 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  43.13 
 
 
513 aa  392  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  47 
 
 
513 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  43.22 
 
 
518 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  42.2 
 
 
527 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  46.04 
 
 
515 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  45.67 
 
 
519 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  42.46 
 
 
519 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.51 
 
 
509 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  45.67 
 
 
519 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.02 
 
 
537 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.05 
 
 
558 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  41.65 
 
 
502 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.19 
 
 
530 aa  382  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  43.14 
 
 
519 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  41.78 
 
 
525 aa  379  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0306  hypothetical protein  42.65 
 
 
535 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.72936  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  42.71 
 
 
532 aa  377  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.65 
 
 
517 aa  378  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  41.41 
 
 
523 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0853  phosphodiesterase  47.2 
 
 
519 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.726014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  41.43 
 
 
522 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  40.76 
 
 
540 aa  374  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1293  phosphodiesterase  50.11 
 
 
517 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000703284  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  43.46 
 
 
517 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  46.73 
 
 
487 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  41.17 
 
 
510 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  42.72 
 
 
521 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  44.55 
 
 
491 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  40.35 
 
 
535 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  40.59 
 
 
509 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.03 
 
 
510 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
509 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2694  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.03 
 
 
527 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.36 
 
 
523 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  40.62 
 
 
535 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 
513 aa  368  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  44.29 
 
 
536 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  43.83 
 
 
509 aa  363  3e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  41.91 
 
 
518 aa  362  9e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  48.81 
 
 
480 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  43.28 
 
 
522 aa  359  8e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  47.44 
 
 
510 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  43.32 
 
 
501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  40.89 
 
 
522 aa  357  1.9999999999999998e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  39.96 
 
 
513 aa  356  3.9999999999999996e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1681  phosphodiesterase  45 
 
 
564 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.24 
 
 
560 aa  355  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>