141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0283 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0283  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
523 aa  1046    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333798  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  45.92 
 
 
511 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  46.47 
 
 
511 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  44.53 
 
 
508 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  45.15 
 
 
524 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.66 
 
 
521 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 
515 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  42.22 
 
 
512 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.68 
 
 
509 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  41.04 
 
 
533 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  41.22 
 
 
533 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  41.98 
 
 
527 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  40.27 
 
 
513 aa  392  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
512 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  45.3 
 
 
513 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  43.4 
 
 
487 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  44.21 
 
 
521 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  43.39 
 
 
518 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 
518 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 
510 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.92 
 
 
522 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  42.61 
 
 
518 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  44.59 
 
 
540 aa  385  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  41.68 
 
 
519 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  41.03 
 
 
519 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  42.38 
 
 
535 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.25 
 
 
516 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  42.86 
 
 
516 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  42.48 
 
 
520 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  43.33 
 
 
521 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  42.53 
 
 
521 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  42.09 
 
 
535 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  48.43 
 
 
487 aa  382  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1608  phosphodiesterase  41.83 
 
 
527 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.92092  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 
517 aa  377  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  43.27 
 
 
520 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  41.95 
 
 
504 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.55 
 
 
537 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1490  metal dependent phophohydrolase  41.25 
 
 
527 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1354  phosphodiesterase  41.83 
 
 
527 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  41.88 
 
 
519 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  40.19 
 
 
520 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  43.29 
 
 
517 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  46.28 
 
 
558 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  42.16 
 
 
511 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  41.81 
 
 
519 aa  379  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  40.27 
 
 
521 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  41.59 
 
 
519 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  41.83 
 
 
514 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  39.81 
 
 
520 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  39.96 
 
 
520 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  39.96 
 
 
520 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  39.96 
 
 
520 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  39.96 
 
 
520 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.51 
 
 
509 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.74 
 
 
560 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  41.88 
 
 
519 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  40.15 
 
 
521 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  46.17 
 
 
502 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  39.81 
 
 
521 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  40.35 
 
 
520 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  40.15 
 
 
520 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  41.73 
 
 
520 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  39.38 
 
 
518 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1425  metal dependent phosphohydrolase  45.03 
 
 
514 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.340697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  41.18 
 
 
515 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
520 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  46.22 
 
 
491 aa  372  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  40.75 
 
 
509 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.91 
 
 
523 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  39.77 
 
 
521 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  45.75 
 
 
510 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  40.94 
 
 
532 aa  365  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  45.01 
 
 
516 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  40.73 
 
 
513 aa  369  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  41.44 
 
 
525 aa  366  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.75 
 
 
530 aa  363  4e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  42.32 
 
 
531 aa  362  9e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  39.72 
 
 
513 aa  359  7e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  39.58 
 
 
509 aa  359  8e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0515  phosphodiesterase  39.88 
 
 
510 aa  358  9e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  40.95 
 
 
510 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  38.04 
 
 
522 aa  357  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  41.49 
 
 
546 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  38.37 
 
 
523 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0306  hypothetical protein  40 
 
 
535 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.72936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  45.33 
 
 
501 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  43.2 
 
 
507 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0162  hypothetical protein  39.08 
 
 
562 aa  355  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.57312 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0853  phosphodiesterase  42.42 
 
 
519 aa  354  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.726014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3992  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  50.87 
 
 
610 aa  352  7e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.748921  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  43.59 
 
 
507 aa  352  7e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  38.16 
 
 
518 aa  351  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  45.11 
 
 
480 aa  349  8e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  35.8 
 
 
522 aa  347  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1293  phosphodiesterase  48.67 
 
 
517 aa  347  3e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000703284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.15 
 
 
520 aa  346  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0859  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
587 aa  346  6e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  39.37 
 
 
519 aa  346  7e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1391  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  46.92 
 
 
588 aa  346  8e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0559611 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>