244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0891 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 391 aa  821    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  48.59 
 
 		 383 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1263  SecC motif-containing protein  49.87 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.638763  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2991  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  41.03 
 
 		 324 aa  232  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4429  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase family protein  33.53 
 
 		 190 aa  99.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3221  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.34 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.16 
 
 		 584 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5906  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  32.26 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.920241  normal  0.561724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.17 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3555  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.83 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.32 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.18 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.95 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498087  normal  0.306024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3190  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.38 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.583182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2689  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  28.74 
 
 		 321 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.64 
 
 		 199 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2874  hypothetical protein  30.72 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.203099  hitchhiker  0.0005762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.65 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.31 
 
 		 199 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.64 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0671  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.82 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0179  hypothetical protein  28.49 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2423  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  35.64 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4878  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  29.65 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2292  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  33 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2128  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  27.5 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312225  normal  0.0716518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3441  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  29.61 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  37.88 
 
 		 971 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0973  preprotein translocase, SecA subunit  35.48 
 
 		 971 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16094  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5085  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.57 
 
 		 256 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193259  normal  0.545985 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  37.29 
 
 		 899 aa  52.8  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1366  preprotein translocase, SecA subunit  42.86 
 
 		 997 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779073  normal  0.444827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  46 
 
 		 903 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  30.85 
 
 		 909 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  33.71 
 
 		 902 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  36.99 
 
 		 939 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 863 aa  50.8  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 921 aa  50.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  29.89 
 
 		 901 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  27.78 
 
 		 907 aa  49.7  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 925 aa  49.7  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  54.29 
 
 		 936 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 917 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4277  preprotein translocase, SecA subunit  56.25 
 
 		 1075 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  31.11 
 
 		 906 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 903 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  44.23 
 
 		 908 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  28.28 
 
 		 917 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  68.18 
 
 		 909 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 931 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  58.33 
 
 		 935 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 931 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 917 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  61.54 
 
 		 908 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 1018 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  28.87 
 
 		 906 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 909 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  28.28 
 
 		 917 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 931 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 931 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 931 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 931 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 931 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  43.4 
 
 		 907 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  44.23 
 
 		 908 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 915 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 936 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  44.23 
 
 		 908 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  51.43 
 
 		 1027 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  44.23 
 
 		 911 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 936 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  31.25 
 
 		 914 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 844 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 893 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 980 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2246  preprotein translocase subunit SecA  39.06 
 
 		 939 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2505  preprotein translocase, SecA subunit  35.94 
 
 		 981 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 994 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  29.55 
 
 		 865 aa  47.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 908 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  46.94 
 
 		 907 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 934 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 932 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 908 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 884 aa  47.4  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 931 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 932 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  51.72 
 
 		 904 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 909 aa  47  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 932 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 908 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 908 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  51.72 
 
 		 904 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 908 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 901 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 915 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 934 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 921 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 919 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 907 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>