28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0163 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0179  hypothetical protein  85.94 
 
 		 192 aa  348  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  77.39 
 
 		 199 aa  325  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  76.38 
 
 		 199 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  76.38 
 
 		 199 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3555  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  74.37 
 
 		 195 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3190  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  46.43 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.583182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.9 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498087  normal  0.306024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4429  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase family protein  36.57 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3221  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.61 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5906  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  32.98 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.920241  normal  0.561724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4878  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  37.8 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.91 
 
 		 284 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.31 
 
 		 227 aa  114  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.52 
 
 		 584 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2874  hypothetical protein  32.46 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.203099  hitchhiker  0.0005762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0671  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.84 
 
 		 266 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2689  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  29.69 
 
 		 321 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.28 
 
 		 261 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  27.6 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  27.65 
 
 		 391 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2991  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.92 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2128  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  30.33 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312225  normal  0.0716518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3441  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  41.86 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1263  SecC motif-containing protein  25.4 
 
 		 372 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.638763  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2292  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  25.81 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2423  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  28.29 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1584  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.7 
 
 		 312 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158822  normal  0.286073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>