43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0161 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 
199 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  96.98 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  96.48 
 
 
199 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  77.39 
 
 
204 aa  325  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3555  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  77.39 
 
 
195 aa  317  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0179  hypothetical protein  76.04 
 
 
192 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3190  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.37 
 
 
211 aa  181  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.583182  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  41.32 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498087  normal  0.306024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4429  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase family protein  38.15 
 
 
190 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4878  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  39.75 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  38.42 
 
 
284 aa  118  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3221  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.84 
 
 
193 aa  117  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5906  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  32.98 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.920241  normal  0.561724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.03 
 
 
227 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36 
 
 
584 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2874  hypothetical protein  32.66 
 
 
227 aa  99.4  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.203099  hitchhiker  0.0005762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2689  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
321 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0671  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.16 
 
 
266 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  37.62 
 
 
261 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  35.64 
 
 
391 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2128  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  30 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312225  normal  0.0716518 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  31.36 
 
 
383 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2991  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.54 
 
 
324 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3441  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  40.7 
 
 
290 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1263  SecC motif-containing protein  34.91 
 
 
372 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.638763  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2292  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  25.54 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871718  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2423  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  31.67 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4091  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.97 
 
 
311 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3870  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.63 
 
 
311 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309565  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1414  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.86 
 
 
312 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4570  hypothetical protein  30.09 
 
 
311 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1584  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.09 
 
 
312 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158822  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0866  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.99 
 
 
300 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4574  hypothetical protein  30.09 
 
 
312 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0566629  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1319  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.09 
 
 
311 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52150  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO2  30.09 
 
 
312 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0295092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4632  membrane-bound beta-hydroxylase  30.48 
 
 
302 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4632  membrane-bound beta-hydroxylase  30.48 
 
 
302 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569284  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4541  membrane-bound beta-hydroxylase  30.48 
 
 
302 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4548  beta-hydroxylase, aspartyl/asparaginyl family  30.48 
 
 
302 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4681  membrane-bound beta-hydroxylase  30.48 
 
 
302 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2463  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.06 
 
 
300 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03631  aspartyl-asparaginyl beta-hydroxylase  31.43 
 
 
301 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>