29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2991 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2991  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 
324 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  42.72 
 
 
383 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  41.03 
 
 
391 aa  232  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1263  SecC motif-containing protein  37.73 
 
 
372 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.638763  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.5 
 
 
584 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
227 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.47 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2874  hypothetical protein  33.53 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.203099  hitchhiker  0.0005762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3221  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.95 
 
 
193 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4429  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase family protein  30.06 
 
 
190 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5906  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  28.14 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.920241  normal  0.561724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2689  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  36.47 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3190  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  37.38 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.583182  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4878  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  33.73 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2423  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  36.8 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.53 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.96 
 
 
195 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498087  normal  0.306024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2292  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  37.04 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871718  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3555  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.92 
 
 
195 aa  63.5  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2128  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  31.58 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312225  normal  0.0716518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0671  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.71 
 
 
266 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.54 
 
 
199 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.92 
 
 
204 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.92 
 
 
199 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.92 
 
 
199 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0179  hypothetical protein  32.17 
 
 
192 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3441  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  34.87 
 
 
290 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3143  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.71 
 
 
388 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2993  hypothetical protein  27.33 
 
 
209 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>