28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3441 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3441  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 
290 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3502  putative L-proline 3-hydroxylase protein  31.83 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5906  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  28.05 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.920241  normal  0.561724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4429  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase family protein  29.65 
 
 
190 aa  59.3  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.86 
 
 
284 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  41.86 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0179  hypothetical protein  36.54 
 
 
192 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  40.7 
 
 
199 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  40.7 
 
 
199 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  40.7 
 
 
199 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  29.61 
 
 
391 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3190  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.2 
 
 
211 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.583182  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2991  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.87 
 
 
324 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3555  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  39.53 
 
 
195 aa  52.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  32.38 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  43.4 
 
 
227 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3221  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  24.71 
 
 
193 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4878  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  35.9 
 
 
200 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238259  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2689  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  41.38 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.65 
 
 
261 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2874  hypothetical protein  30.88 
 
 
227 aa  46.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.203099  hitchhiker  0.0005762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0671  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  41.51 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.75 
 
 
584 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  38.2 
 
 
195 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498087  normal  0.306024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1263  SecC motif-containing protein  30 
 
 
372 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.638763  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1414  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.22 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2128  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  39.62 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312225  normal  0.0716518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2423  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  25.19 
 
 
234 aa  42.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  0.435049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>