32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0671 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0671  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50.57 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  37.82 
 
 		 284 aa  145  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.87 
 
 		 584 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.83 
 
 		 227 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3221  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.75 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2874  hypothetical protein  32.58 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.203099  hitchhiker  0.0005762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4429  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase family protein  32.97 
 
 		 190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4878  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  38.17 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  37.16 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498087  normal  0.306024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3190  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.08 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.583182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5906  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  29.06 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.920241  normal  0.561724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.84 
 
 		 204 aa  99  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.15 
 
 		 199 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2689  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  38.46 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.16 
 
 		 199 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.17 
 
 		 199 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0179  hypothetical protein  34.81 
 
 		 192 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3555  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 		 195 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  28.25 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2128  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  42.5 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312225  normal  0.0716518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  28.82 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1263  SecC motif-containing protein  25.13 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.638763  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2991  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.71 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3770  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  34.12 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.856849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3051  hypothetical protein  42.86 
 
 		 95 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2423  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  40 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3441  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  41.51 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3052  hypothetical protein  38.18 
 
 		 101 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3050  hypothetical protein  34.43 
 
 		 103 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.24506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3143  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 		 388 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3053  hypothetical protein  33.93 
 
 		 96 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.487734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>