102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3143 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3143  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 
388 aa  773    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220325  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3110  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.42 
 
 
399 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1816  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.28 
 
 
388 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  39.81 
 
 
353 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44410  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  37.7 
 
 
255 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44380  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  36.26 
 
 
254 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238652  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02817  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  31.48 
 
 
330 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3665  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  34.69 
 
 
322 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2982  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  33.71 
 
 
248 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3497  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.63 
 
 
276 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1078  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.83 
 
 
267 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1613  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.15 
 
 
278 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5085  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.26 
 
 
256 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193259  normal  0.545985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3668  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  31 
 
 
317 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406515  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46074  predicted protein  30 
 
 
380 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1730  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.6 
 
 
262 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5927  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.54 
 
 
311 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0104695  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46818  predicted protein  37 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3460  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
304 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3524  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
304 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196808  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2530  hypothetical protein  32 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3377  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2383  hypothetical protein  32 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3870  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.84 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309565  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4570  hypothetical protein  30.37 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1319  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.37 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1414  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.43 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0571  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0896  beta-hydroxylase  33.33 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2019  beta-hydroxylase  33.33 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1927  beta-hydroxylase  33.33 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1863  beta-hydroxylase  33.33 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4091  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.84 
 
 
311 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4574  hypothetical protein  29.32 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0566629  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0445  asparaginyl beta-hydroxylase  32.56 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3198  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.17 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.966263  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2028  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52150  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO2  28.8 
 
 
312 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0295092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0466  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.85 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0971  asparaginyl beta-hydroxylase  31.78 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.916669  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2325  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44132  predicted protein  29 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0240855  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35118  predicted protein  26.69 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1584  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.34 
 
 
312 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158822  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3204  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.84 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.84 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.784286  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5116  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.84 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5679  putative aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.15 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03631  aspartyl-asparaginyl beta-hydroxylase  30.29 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2612  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.86 
 
 
299 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2054  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.65 
 
 
300 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332449  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.56 
 
 
229 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.405318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3076  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19091  hypothetical protein  39.29 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0440547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2063  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.15 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5084  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.09 
 
 
229 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3272  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.15 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4559  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.34 
 
 
229 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.524897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2423  hypothetical protein  34.17 
 
 
299 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.695409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3901  hypothetical protein  28.96 
 
 
312 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2463  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.54 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3770  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  34.72 
 
 
302 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.856849 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0347  hypothetical protein  34.15 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119011  hitchhiker  0.000140688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3964  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  34.15 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51640  Lipopolysaccharide biosynthetic protein  30.89 
 
 
299 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.664439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1756  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  27.85 
 
 
300 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1877  putative aspartyl/asparaginyl BETA-hydroxylase transmembrane protein  26.9 
 
 
300 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2078  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  26.9 
 
 
300 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0866  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.58 
 
 
300 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58550  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO1  31.71 
 
 
299 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2021  beta-hydroxylase  31.2 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2921  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.54 
 
 
316 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0568  hypothetical protein  31.2 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474129  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0446  hypothetical protein  31.2 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0898  hypothetical protein  31.2 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.838267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1928  beta-hydroxylase  31.2 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.101545  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1865  hypothetical protein  31.2 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44505  predicted protein  30.99 
 
 
521 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4632  membrane-bound beta-hydroxylase  30.95 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4632  membrane-bound beta-hydroxylase  30.95 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569284  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4541  membrane-bound beta-hydroxylase  30.95 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4548  beta-hydroxylase, aspartyl/asparaginyl family  30.95 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4681  membrane-bound beta-hydroxylase  30.95 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5126  hypothetical protein  31.71 
 
 
299 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.97 
 
 
299 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245223  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0306  hypothetical protein  30.65 
 
 
252 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.497048  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0925  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.2 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60975  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3981  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.58 
 
 
299 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0821  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.2 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4278  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.62 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.58 
 
 
299 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4088  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.83 
 
 
299 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3435  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.83 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2038  hypothetical protein  26.32 
 
 
260 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1263  SecC motif-containing protein  29.41 
 
 
372 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.638763  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  33.33 
 
 
383 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2991  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.71 
 
 
324 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  32 
 
 
391 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.08 
 
 
284 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2292  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  31.07 
 
 
188 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>