51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5927 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5927  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 		 311 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0104695  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.19 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3143  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3668  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  29.32 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3665  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  30.89 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35118  predicted protein  24.88 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1816  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.52 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3110  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.59 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1613  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.8 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44410  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  28.46 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878318  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44132  predicted protein  26.47 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0240855  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3497  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.8 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02817  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  33 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46818  predicted protein  28.76 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46074  predicted protein  26.32 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1078  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  23.72 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44380  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  26.72 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1730  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.7 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2982  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  25.86 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2530  hypothetical protein  28.91 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1877  putative aspartyl/asparaginyl BETA-hydroxylase transmembrane protein  28.34 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2383  hypothetical protein  29.13 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1756  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  26.6 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2078  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  26.6 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2463  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.06 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5679  putative aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0866  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5085  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.84 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193259  normal  0.545985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58550  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO1  24.26 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4548  beta-hydroxylase, aspartyl/asparaginyl family  21.93 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4681  membrane-bound beta-hydroxylase  21.93 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4541  membrane-bound beta-hydroxylase  21.93 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4632  membrane-bound beta-hydroxylase  21.93 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4632  membrane-bound beta-hydroxylase  21.93 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51640  Lipopolysaccharide biosynthetic protein  24.6 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.664439  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0347  hypothetical protein  23.66 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119011  hitchhiker  0.000140688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5126  hypothetical protein  23.27 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3770  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  25.82 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.856849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2325  hypothetical protein  23.5 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1414  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  23.04 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3460  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  25.99 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3870  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  22.51 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4574  hypothetical protein  23.56 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0566629  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1865  hypothetical protein  24.75 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1928  beta-hydroxylase  24.75 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.101545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2021  beta-hydroxylase  24.3 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0898  hypothetical protein  24.75 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.838267  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0446  hypothetical protein  24.75 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0568  hypothetical protein  24.75 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52150  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO2  23.04 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0295092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3524  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  25.42 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>