224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1263 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1263  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 372 aa  776    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.638763  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  57.18 
 
 		 383 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  49.87 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2991  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  37.73 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2874  hypothetical protein  33.93 
 
 		 227 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.203099  hitchhiker  0.0005762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4429  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase family protein  31.11 
 
 		 190 aa  92.8  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.73 
 
 		 584 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.34 
 
 		 227 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3221  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.94 
 
 		 193 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.43 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.55 
 
 		 195 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498087  normal  0.306024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5906  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  29.76 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.920241  normal  0.561724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.14 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0671  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.13 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4878  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  30.36 
 
 		 200 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3190  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.62 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.583182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2292  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  32.56 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2423  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  31.19 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2689  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  24.9 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0179  hypothetical protein  28.91 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.91 
 
 		 199 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.4 
 
 		 204 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.96 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.96 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2128  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  26.32 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312225  normal  0.0716518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3555  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.83 
 
 		 195 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  41.82 
 
 		 917 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3143  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.41 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  29.63 
 
 		 903 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  32.64 
 
 		 838 aa  53.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  28.3 
 
 		 925 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2246  preprotein translocase subunit SecA  37.1 
 
 		 939 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4277  preprotein translocase, SecA subunit  44.26 
 
 		 1075 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  23.08 
 
 		 899 aa  50.1  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  41.51 
 
 		 916 aa  49.7  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  28.93 
 
 		 1067 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  24.12 
 
 		 899 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  52.94 
 
 		 912 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  27.64 
 
 		 930 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  40.68 
 
 		 937 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  28.99 
 
 		 837 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  29.36 
 
 		 916 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  29.36 
 
 		 913 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  25.23 
 
 		 922 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  38.71 
 
 		 911 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  28.83 
 
 		 962 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  56.25 
 
 		 904 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 		 907 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0943  SecC motif-containing protein  60 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368461  hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  26.85 
 
 		 917 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0973  preprotein translocase, SecA subunit  35.82 
 
 		 971 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16094  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  28.83 
 
 		 962 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  40.85 
 
 		 992 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  28.83 
 
 		 962 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 932 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  25.21 
 
 		 933 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  22.01 
 
 		 955 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  38.71 
 
 		 939 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1420  protein translocase subunit SecA  25.2 
 
 		 935 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0249781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  53.57 
 
 		 915 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  56.67 
 
 		 920 aa  47.4  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 930 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  35.09 
 
 		 865 aa  47  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  61.54 
 
 		 980 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  36.76 
 
 		 934 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 911 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  64 
 
 		 911 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  40 
 
 		 949 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  31.91 
 
 		 905 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2655  SEC-C motif domain protein  36.17 
 
 		 792 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  53.57 
 
 		 906 aa  46.6  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 911 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 911 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  64 
 
 		 868 aa  46.6  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  42 
 
 		 908 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  42 
 
 		 908 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  42 
 
 		 908 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  56.67 
 
 		 910 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 931 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  41.67 
 
 		 956 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 924 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 931 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3831  preprotein translocase subunit SecA  30.85 
 
 		 905 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  40.82 
 
 		 907 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 930 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 909 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2599  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 901 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.213228  normal  0.874755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  28.32 
 
 		 917 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  27.03 
 
 		 921 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  28.32 
 
 		 917 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 931 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  26.36 
 
 		 919 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 931 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  38 
 
 		 908 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 931 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 931 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 931 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2761  preprotein translocase subunit SecA  34.43 
 
 		 906 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  43.4 
 
 		 954 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  53.57 
 
 		 911 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>