52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2689 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2689  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 
321 aa  648    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2128  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  62.07 
 
 
363 aa  391  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312225  normal  0.0716518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5906  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  31.41 
 
 
226 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.920241  normal  0.561724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.5 
 
 
199 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3555  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.46 
 
 
195 aa  96.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
199 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.5 
 
 
199 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4878  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  39.42 
 
 
200 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238259  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.69 
 
 
204 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  37.58 
 
 
195 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498087  normal  0.306024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0671  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  38.46 
 
 
266 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3190  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.03 
 
 
211 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.583182  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
584 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.78 
 
 
227 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3221  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.64 
 
 
193 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.43 
 
 
261 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0179  hypothetical protein  29.03 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4429  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase family protein  29.89 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2874  hypothetical protein  32.84 
 
 
227 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.203099  hitchhiker  0.0005762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2991  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.47 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  28.74 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  29.07 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1263  SecC motif-containing protein  24.9 
 
 
372 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.638763  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2423  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  37.76 
 
 
234 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2325  hypothetical protein  29.59 
 
 
300 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2054  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.28 
 
 
300 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332449  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58550  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO1  32.65 
 
 
299 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0925  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.65 
 
 
301 aa  49.3  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0821  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.65 
 
 
301 aa  49.3  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.65 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.405318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3441  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  41.38 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03631  aspartyl-asparaginyl beta-hydroxylase  32.65 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2993  hypothetical protein  31.07 
 
 
209 aa  47  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4559  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.77 
 
 
229 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.524897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2028  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.91 
 
 
304 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961089  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5084  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.77 
 
 
229 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5126  hypothetical protein  31.63 
 
 
299 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0466  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.77 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5116  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.73 
 
 
229 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.73 
 
 
229 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.784286  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3204  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.73 
 
 
229 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0445  asparaginyl beta-hydroxylase  25.14 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3198  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.21 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.966263  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0971  asparaginyl beta-hydroxylase  32.04 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.916669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2612  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1863  beta-hydroxylase  25 
 
 
230 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1927  beta-hydroxylase  25 
 
 
230 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2019  beta-hydroxylase  25 
 
 
230 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0896  beta-hydroxylase  25 
 
 
230 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0571  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3665  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  28.44 
 
 
322 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>