58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2128 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2128  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 
363 aa  719    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312225  normal  0.0716518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2689  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  62.07 
 
 
321 aa  404  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5906  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  31.33 
 
 
226 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.920241  normal  0.561724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.62 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498087  normal  0.306024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4878  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  37.4 
 
 
200 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4429  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase family protein  28.57 
 
 
190 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2739  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.54 
 
 
584 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.14 
 
 
227 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0671  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  40.62 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3221  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.53 
 
 
193 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3190  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.61 
 
 
211 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.583182  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.52 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.67 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.67 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2874  hypothetical protein  30.15 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.203099  hitchhiker  0.0005762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  26.9 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.87 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2991  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.58 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  27.5 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3555  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.6 
 
 
195 aa  63.5  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.33 
 
 
204 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1263  SecC motif-containing protein  26.32 
 
 
372 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.638763  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0179  hypothetical protein  28.7 
 
 
192 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2054  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.58 
 
 
300 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332449  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5116  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.45 
 
 
229 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3204  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.45 
 
 
229 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.45 
 
 
229 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.784286  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4559  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.64 
 
 
229 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.524897 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5084  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.58 
 
 
229 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0466  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.58 
 
 
229 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.58 
 
 
229 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.405318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3198  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.92 
 
 
228 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.966263  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58550  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO1  34.34 
 
 
299 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2325  hypothetical protein  31.37 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3377  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.27 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5126  hypothetical protein  34.34 
 
 
299 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2530  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2028  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
304 aa  46.6  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2423  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  36.43 
 
 
234 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2383  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3460  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  34.31 
 
 
304 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0821  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.35 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0445  asparaginyl beta-hydroxylase  34.31 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3524  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  34.31 
 
 
304 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196808  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0925  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.35 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3441  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  39.62 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0971  asparaginyl beta-hydroxylase  31.97 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.916669  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1613  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.57 
 
 
278 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1730  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.82 
 
 
262 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0896  beta-hydroxylase  33.98 
 
 
230 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0571  hypothetical protein  33.98 
 
 
230 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3964  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
298 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2612  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 
299 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5085  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.77 
 
 
256 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193259  normal  0.545985 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1863  beta-hydroxylase  33.98 
 
 
230 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1927  beta-hydroxylase  33.98 
 
 
230 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2019  beta-hydroxylase  33.98 
 
 
230 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>