76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0023 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0023  transposase  100 
 
 		 70 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.698487 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  95.71 
 
 		 435 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  65 
 
 		 771 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  55.22 
 
 		 1006 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  53.85 
 
 		 991 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  53.85 
 
 		 991 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  52.31 
 
 		 997 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  47.76 
 
 		 1075 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  52.31 
 
 		 1028 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  52.31 
 
 		 916 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  45 
 
 		 1029 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  44.78 
 
 		 838 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  42.62 
 
 		 990 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  42.62 
 
 		 755 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  42.62 
 
 		 990 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  42.62 
 
 		 990 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  42.62 
 
 		 990 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  42.62 
 
 		 990 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  39.34 
 
 		 988 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  39.34 
 
 		 339 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  40.98 
 
 		 990 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  40.98 
 
 		 990 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  38.71 
 
 		 224 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  37.7 
 
 		 988 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  37.7 
 
 		 988 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  37.5 
 
 		 988 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  37.5 
 
 		 988 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  38.33 
 
 		 862 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  38.33 
 
 		 994 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  38.33 
 
 		 550 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  38.33 
 
 		 994 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  39.34 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  37.7 
 
 		 964 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  39.34 
 
 		 264 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0012  putative transposase  41.67 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.65506  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  37.7 
 
 		 988 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  37.7 
 
 		 988 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  38.33 
 
 		 246 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  37.7 
 
 		 988 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  38.33 
 
 		 246 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  37.7 
 
 		 988 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  40 
 
 		 992 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  40 
 
 		 992 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  37.7 
 
 		 988 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  37.7 
 
 		 989 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  37.7 
 
 		 988 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  37.7 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  37.7 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  37.7 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  38.33 
 
 		 994 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  38.98 
 
 		 991 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  38.33 
 
 		 338 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  35 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  38.98 
 
 		 991 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  38.33 
 
 		 983 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  32.31 
 
 		 988 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  32.31 
 
 		 988 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  32.31 
 
 		 988 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  36.07 
 
 		 606 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  34.43 
 
 		 988 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  36.07 
 
 		 255 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  36.07 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  36.07 
 
 		 988 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  34.43 
 
 		 988 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  36.07 
 
 		 988 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  33.9 
 
 		 371 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  36.07 
 
 		 310 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  34.43 
 
 		 305 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  30.77 
 
 		 1015 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  33.87 
 
 		 989 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  37.74 
 
 		 988 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  37.74 
 
 		 988 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  35 
 
 		 992 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  37.29 
 
 		 987 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  30.88 
 
 		 991 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  32.84 
 
 		 977 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>