65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3799 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  473  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  52.29 
 
 
226 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  52.25 
 
 
235 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  52.25 
 
 
235 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  52.25 
 
 
235 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  51.35 
 
 
235 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  50.45 
 
 
231 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  50.45 
 
 
231 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  52.31 
 
 
233 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  49.55 
 
 
233 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  49.55 
 
 
233 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  49.55 
 
 
233 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  50 
 
 
231 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  48 
 
 
233 aa  224  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  51.89 
 
 
233 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  49.78 
 
 
233 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  54.95 
 
 
227 aa  217  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  56.86 
 
 
223 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  45.78 
 
 
244 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  45.33 
 
 
323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  45.79 
 
 
237 aa  181  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  45.25 
 
 
227 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  45.25 
 
 
235 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  46.01 
 
 
227 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  46.53 
 
 
231 aa  174  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  40.65 
 
 
225 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  40.19 
 
 
225 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  43.53 
 
 
230 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  40.18 
 
 
232 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  37.32 
 
 
226 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  40.82 
 
 
221 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  41.12 
 
 
223 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  39.8 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  39.29 
 
 
221 aa  131  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  40.1 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  41.12 
 
 
223 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  42.41 
 
 
190 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  36.45 
 
 
226 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  30.92 
 
 
229 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  37.86 
 
 
233 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  35.2 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  28.31 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  35.53 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  35.29 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  35.17 
 
 
237 aa  79  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  29.63 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  27.48 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  33.57 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  37.8 
 
 
254 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  33.57 
 
 
230 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  37.4 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  31.21 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  37.39 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  32.52 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  30.72 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  32.79 
 
 
258 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  33.88 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  31.09 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  25 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  30.47 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  30.4 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  30.58 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  28.81 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  27.97 
 
 
251 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>