29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1716 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  58.06 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  57.54 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  57.03 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  56.22 
 
 		 250 aa  242  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  47.41 
 
 		 264 aa  214  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  43.59 
 
 		 246 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  41.25 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  38.6 
 
 		 241 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  42.21 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  41 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  35.48 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  39.13 
 
 		 258 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  37.27 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  36.6 
 
 		 202 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  40.22 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  38.32 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  41.05 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  36.73 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  39.11 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  38.55 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  35.85 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  27.43 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  29.77 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  26.09 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  28.71 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  33.08 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  27.51 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>