61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1859 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  477  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  53.64 
 
 		 223 aa  244  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  48.62 
 
 		 231 aa  224  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  54.95 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  46.57 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  46.57 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  43.32 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  46.92 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  44.55 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  43.06 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  43.3 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  45.85 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  43.3 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  43.3 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  42.41 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  41.82 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  41.82 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  41.82 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  43.27 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  41.82 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  41.82 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  41.82 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  40.91 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  41.35 
 
 		 323 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  39.35 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  40.76 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  39.35 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  42.16 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  41.2 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  36.2 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  40.11 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  34.74 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  34.27 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  33.8 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  34.12 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  31.96 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  30.95 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  34.12 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  36.22 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  29.72 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  31.13 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  27.54 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  33.88 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  30.87 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  30.94 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  29.07 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  32.5 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  27.94 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  24.24 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  32.5 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  28.26 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  26.95 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  31.15 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  31.15 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  31.4 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  26.09 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  33.06 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  29.37 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  27.41 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  29.66 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>