52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2207 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  89.71 
 
 		 244 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  68.22 
 
 		 237 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  56.39 
 
 		 227 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  55.22 
 
 		 235 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  56.95 
 
 		 227 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  51.05 
 
 		 232 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  45.33 
 
 		 229 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  40.55 
 
 		 226 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  41.35 
 
 		 227 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  44.02 
 
 		 223 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  39.17 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  40.65 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  41.01 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  40.65 
 
 		 233 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  40.19 
 
 		 235 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  40.19 
 
 		 231 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  40.09 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  38.71 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  38.71 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  40.09 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  40.09 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  38.71 
 
 		 235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  37.38 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  36.41 
 
 		 233 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  37.74 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  37.74 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  32.59 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  37.38 
 
 		 231 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  36.11 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  29.11 
 
 		 229 aa  96.3  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  34.38 
 
 		 190 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  36.63 
 
 		 232 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  30.88 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  30.96 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  37.71 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  30.15 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  28.06 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  32.08 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  31.47 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  29.44 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  28.64 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  29.09 
 
 		 238 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  28.95 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  31.03 
 
 		 227 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  28.57 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  23.74 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  29.17 
 
 		 230 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  29.59 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  27.01 
 
 		 228 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  29.41 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>