43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4082 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  47.32 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  45.09 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5839  hypothetical protein  44.44 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  36.73 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  29.22 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  29.22 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  29.63 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  32.69 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  30.73 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  33.82 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  30 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  30.39 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  27.59 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  27.86 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  27.86 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  27.44 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  27.36 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  27.36 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  31.13 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  27.36 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  27.36 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  27.36 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  27.36 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  26.98 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  26.24 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  26.87 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  31.9 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  25.62 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  30.53 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  30.3 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  26.37 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  30.94 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  58.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  26.37 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  32.22 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  24.53 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  29.49 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  29.68 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  26.94 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  25.39 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  25.39 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  26.24 
 
 		 228 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>