62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4397 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  84.98 
 
 		 233 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  83.69 
 
 		 233 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  75.11 
 
 		 235 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  75.11 
 
 		 235 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  75.11 
 
 		 235 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  75.22 
 
 		 231 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  76.65 
 
 		 235 aa  363  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  73.39 
 
 		 233 aa  360  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  73.39 
 
 		 233 aa  360  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  73.39 
 
 		 233 aa  360  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  74.67 
 
 		 231 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  77.63 
 
 		 233 aa  359  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  75 
 
 		 231 aa  358  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  66.07 
 
 		 226 aa  313  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  48 
 
 		 229 aa  224  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  43.06 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  42.13 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  40.09 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  39.17 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  40.55 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  35.68 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  39.91 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  35.32 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  35.21 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  39.9 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  37.96 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  37.16 
 
 		 227 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  36.24 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  37.04 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  34.85 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  38.74 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  39.44 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  38.04 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  34.85 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  33.17 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  32.68 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  35.57 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  29.25 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  26.76 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  26.94 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  31.54 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  30.6 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  31.97 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  36.89 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  27.94 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  38.46 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  29.71 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  26.37 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  25.6 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  28.26 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  37.82 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  41.74 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  34.48 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  36.97 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  37.07 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  35.65 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  35.51 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  37.39 
 
 		 220 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  32.86 
 
 		 243 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>