64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2252 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  90.43 
 
 
233 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  90.04 
 
 
231 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  89.61 
 
 
231 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  90.43 
 
 
233 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  90.43 
 
 
233 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  91.78 
 
 
233 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  83.04 
 
 
235 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  82.61 
 
 
235 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  82.61 
 
 
235 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  83.56 
 
 
235 aa  394  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  75.22 
 
 
233 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  76.09 
 
 
233 aa  363  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  74.35 
 
 
233 aa  359  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  68 
 
 
226 aa  321  7e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  50.45 
 
 
229 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  41.82 
 
 
227 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  40.36 
 
 
244 aa  155  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  41.01 
 
 
323 aa  151  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  41.74 
 
 
230 aa  151  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  38.21 
 
 
226 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  40.28 
 
 
237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  39.64 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  36.15 
 
 
225 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  36.15 
 
 
225 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  39.35 
 
 
235 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  38.43 
 
 
227 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  36.94 
 
 
227 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  37.16 
 
 
232 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  38.42 
 
 
231 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  39.18 
 
 
190 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  33.84 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  39.13 
 
 
223 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  35.35 
 
 
231 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  37.37 
 
 
223 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  34.26 
 
 
232 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  32.2 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  31.71 
 
 
221 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  36.87 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  29.78 
 
 
244 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  31.6 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  27.7 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  33.56 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  38.4 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  32.09 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  27.59 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  30.15 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  38.33 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  38.66 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  33.08 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  38.89 
 
 
221 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  39.66 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  33.81 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  30.08 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  36.52 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  35.65 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  30.6 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  35.59 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3732  hypothetical protein  30.51 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  26.73 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  33.33 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  30.43 
 
 
243 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  34.26 
 
 
256 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  35.04 
 
 
241 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>