45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00942 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  34.84 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  34.58 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  30.92 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  32.42 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  31.82 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  31.96 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  31.02 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  30.23 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  29.11 
 
 		 323 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  28.64 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  29.11 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  31.86 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  28.37 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  28.44 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  29.58 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  29.58 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  29.58 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  28 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  27.06 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  27.06 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  27.06 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  26.76 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  29.11 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  27.52 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  32.14 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  27.7 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  32.14 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  27.19 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  27.06 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  24.64 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  23.32 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  24.65 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  22.87 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  23.2 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  23.96 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  21.13 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  24.76 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  27.15 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  26.7 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  25.11 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  25.24 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  32.17 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  28.42 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>