52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26280 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  53.64 
 
 		 227 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  51.13 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  56.86 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  47.78 
 
 		 225 aa  207  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  47.29 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  46.48 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  41.89 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  44.24 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  46.01 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  45.24 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  44.02 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  40.45 
 
 		 233 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  39.63 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  42.2 
 
 		 237 aa  154  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  40.27 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  40.55 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  40 
 
 		 233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  39.82 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  40.09 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  39.82 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  39.37 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  38.29 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  39.64 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  38.29 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  40.89 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  35.19 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  38.07 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  39.44 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  36.92 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  37.76 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  36.41 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  35.86 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  31.86 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  35.86 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  34.39 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  34.72 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  32.43 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  27.43 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  31.9 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  34.33 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  31.85 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  26.2 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  31.34 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  34.56 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  33.08 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  33.09 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  28.97 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  34.86 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>