46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0679 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  81.48 
 
 		 230 aa  322  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  42.41 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  40.34 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  41.67 
 
 		 233 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  40.11 
 
 		 227 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  40.51 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  39.18 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  39.49 
 
 		 233 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  39.49 
 
 		 233 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  38.74 
 
 		 233 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  40 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  39.49 
 
 		 233 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  38.22 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  38.22 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  36.46 
 
 		 244 aa  104  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  39.44 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  37.57 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  34.38 
 
 		 323 aa  95.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  32.97 
 
 		 227 aa  94.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  36.16 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  34.44 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  34.44 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  32.78 
 
 		 237 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  30.27 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  32.63 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  30.27 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  35.09 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  32.22 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  29.7 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  34.94 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  32.74 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  30.08 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  29.77 
 
 		 248 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  28.15 
 
 		 254 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  27.41 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  30.3 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  28.42 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  30.12 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  28.38 
 
 		 243 aa  41.6  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  29.6 
 
 		 237 aa  41.2  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>