47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7073 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  89.69 
 
 
223 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  72.4 
 
 
223 aa  337  8e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  64.68 
 
 
221 aa  296  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  64.22 
 
 
221 aa  295  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  62.5 
 
 
221 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  40.1 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  35.86 
 
 
235 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  34.85 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  34.85 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  34.85 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  35.35 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  35.35 
 
 
231 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  32.87 
 
 
233 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  34.12 
 
 
227 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  34.85 
 
 
233 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  34.85 
 
 
233 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  33.33 
 
 
233 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  34.85 
 
 
233 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  35.35 
 
 
233 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  34.85 
 
 
231 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  35.35 
 
 
231 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  32.65 
 
 
225 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  31.43 
 
 
233 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  33.83 
 
 
231 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  37.76 
 
 
223 aa  99  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  32.14 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  28.64 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  31.92 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  37.07 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  36.36 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  36.36 
 
 
227 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  35.86 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  31.84 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  33.66 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  29.95 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  32.69 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  30.15 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  33 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  23.96 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  28.7 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  31.48 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  25.9 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  25.86 
 
 
230 aa  45.1  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  30.3 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  32.14 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>