46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5936 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  89.69 
 
 
231 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  72.2 
 
 
223 aa  336  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  64.09 
 
 
221 aa  293  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  63.64 
 
 
221 aa  291  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  62.96 
 
 
221 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  41.12 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  38.89 
 
 
235 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  37.88 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  37.88 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  37.88 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  37.88 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  37.88 
 
 
233 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  35.35 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  34.85 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  36.87 
 
 
231 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  37.37 
 
 
233 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  37.37 
 
 
233 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  37.37 
 
 
233 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  34.85 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  37.37 
 
 
231 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  35.35 
 
 
226 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  30.36 
 
 
226 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  33.5 
 
 
225 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  34.12 
 
 
227 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  34.18 
 
 
231 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  32.99 
 
 
225 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  35.86 
 
 
223 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  34.65 
 
 
226 aa  98.2  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  37.07 
 
 
233 aa  91.7  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  35.86 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  35.35 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  36.68 
 
 
235 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  32.18 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  34.1 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  34 
 
 
244 aa  79  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  31.47 
 
 
323 aa  78.6  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  31.71 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  33.82 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  28.93 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  24.76 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  27.83 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  26.62 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  30.56 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  30.12 
 
 
190 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  26.5 
 
 
230 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>