53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2247 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  100 
 
 		 244 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  61.98 
 
 		 245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  64.81 
 
 		 221 aa  291  9e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  59.26 
 
 		 218 aa  238  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  51.88 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  47.52 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  47.12 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  48.52 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  49.02 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  44.98 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  45.54 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  47.19 
 
 		 220 aa  144  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  46.6 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  37.82 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  35.75 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  35.85 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  39.23 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  34.92 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  38.86 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  36.84 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  37.65 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  39.2 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  39.2 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  39.2 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  38.4 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  38.4 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  37.6 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  36.89 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  35.2 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  35.2 
 
 		 231 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  36.8 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  36.8 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  36.8 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  35.2 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  35.25 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  35.25 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  32.52 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  29.07 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  29.53 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  29.53 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  28.39 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  31.48 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  31.18 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  30.56 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  29.41 
 
 		 323 aa  48.9  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  28.97 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  30.77 
 
 		 232 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  29.13 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  29.41 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  28.43 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  27.45 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  30.97 
 
 		 238 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>