23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2090 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  58.06 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  53.16 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  52.97 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  51.69 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  44.71 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  40.47 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  42.37 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  36.29 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  34.18 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  36.16 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  40.96 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  34.26 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  33.19 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  35.1 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  34.65 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  38.92 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  35.75 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  34.43 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  36.62 
 
 		 218 aa  99  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  36.79 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  32.46 
 
 		 202 aa  89  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>