49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0589 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  74.88 
 
 		 218 aa  322  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  61.98 
 
 		 244 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  63.72 
 
 		 221 aa  278  6e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  57.32 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  51.03 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  50.62 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  52.45 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  48.1 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  47.11 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  44.72 
 
 		 202 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  42.92 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  44.86 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  38.63 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  45.32 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  33.19 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  39.02 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  38.57 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  36.73 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  38.46 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  39.88 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  35.29 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  31.93 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  38.66 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  32.5 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  37.82 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  36.97 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  36.13 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  36.97 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  36.97 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  37.82 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  35.48 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  34.13 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  34.13 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  34.51 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  35.29 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  32.14 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  34.45 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  33.61 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  32.11 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  35 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  31.09 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  31.86 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  28.36 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  28.36 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  32.14 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  33.03 
 
 		 223 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  30.5 
 
 		 244 aa  42  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>