22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3334 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  71.89 
 
 		 251 aa  351  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  71.49 
 
 		 252 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  56.22 
 
 		 248 aa  261  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  53.16 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  42.02 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  45.14 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  41.53 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  40.27 
 
 		 241 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  39.63 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  37.8 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  41.15 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  36.48 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  39.02 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  45.1 
 
 		 218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  36.51 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  38.83 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  39.46 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  36.84 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  37.13 
 
 		 258 aa  118  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  35.75 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  36.09 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>