28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1218 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  79.07 
 
 		 250 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  51.69 
 
 		 241 aa  215  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  48.1 
 
 		 245 aa  184  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  47.12 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  45.67 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  47.64 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  46.76 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  43.32 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  44.26 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  43.55 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  42.16 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  34.65 
 
 		 248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  39.22 
 
 		 258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  39.53 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  39.47 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  38.55 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  41.11 
 
 		 251 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  38.67 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  40.66 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  34.38 
 
 		 246 aa  91.7  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  35.75 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  32.84 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  32.74 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  33.88 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  37.39 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  26.23 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  37.39 
 
 		 233 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>