37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0638 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  52.73 
 
 
254 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  54.21 
 
 
220 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  48.61 
 
 
258 aa  181  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  47.11 
 
 
245 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  47.93 
 
 
250 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  46.49 
 
 
243 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  47.51 
 
 
237 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  44.98 
 
 
244 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  44.34 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  44.95 
 
 
221 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  46.08 
 
 
218 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  44.26 
 
 
220 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  36.16 
 
 
248 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  41 
 
 
248 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  38.92 
 
 
256 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  39.04 
 
 
252 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  35.32 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  39.09 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  36.48 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  37.11 
 
 
202 aa  99.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  31.33 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  33.09 
 
 
231 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  33.81 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  33.09 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  34.48 
 
 
233 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  32.54 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  32.84 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  32.37 
 
 
233 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  32.84 
 
 
235 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  32.37 
 
 
233 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  32.37 
 
 
233 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  32.84 
 
 
235 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  31.09 
 
 
233 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  34.33 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  31.09 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  28.81 
 
 
229 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>