61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2608 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  99.15 
 
 
235 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  96.17 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  83.26 
 
 
233 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  83.26 
 
 
233 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  83.26 
 
 
233 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  83.48 
 
 
231 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  82.61 
 
 
231 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  86.76 
 
 
233 aa  394  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  82.61 
 
 
231 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  75.11 
 
 
233 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  76.39 
 
 
233 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  75.97 
 
 
233 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  67.41 
 
 
226 aa  315  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  52.25 
 
 
229 aa  238  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  43.3 
 
 
227 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  40.83 
 
 
244 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  37.9 
 
 
226 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  39.82 
 
 
223 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  36.62 
 
 
225 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  38.71 
 
 
323 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  40.17 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  36.15 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  40.91 
 
 
230 aa  144  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  38.57 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  38.6 
 
 
235 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  38.14 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  41.09 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  34.55 
 
 
232 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  35.35 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  40 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  39.67 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  37.88 
 
 
223 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  34.85 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  34.85 
 
 
221 aa  105  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  38.53 
 
 
233 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  34.34 
 
 
221 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  34.07 
 
 
232 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  29.58 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  30.19 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  27.8 
 
 
244 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  32.89 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  27.36 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  31.34 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  36.8 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  29.1 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  33.56 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  30.23 
 
 
230 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  29.1 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  34.13 
 
 
245 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  25.6 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  36.84 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  32.84 
 
 
255 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  30.82 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  34.19 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  36.97 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  31.09 
 
 
252 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  31.09 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  27.54 
 
 
227 aa  41.6  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>