41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2805 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  48.36 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  49.17 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  52.45 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  45.27 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  46.49 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  49.02 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  49.76 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  43.41 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  41.35 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  42.93 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  48.89 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  42.42 
 
 		 202 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  42.16 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  35.94 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  37.27 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  38.92 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  38.46 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  33.94 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  41.03 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  38.83 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  30.59 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  30.72 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  32.41 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  26.2 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  31.13 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  31.4 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  28.48 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  34.04 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  31.16 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  31.16 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  31.16 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  29.71 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  29.71 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  32.46 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  30.36 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3732  hypothetical protein  28.04 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  29.37 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  30.83 
 
 		 232 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  30.43 
 
 		 231 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  32.86 
 
 		 233 aa  42  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>