47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2812 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  57.32 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  50.82 
 
 		 250 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  51.88 
 
 		 244 aa  229  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  54.88 
 
 		 218 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  54.55 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  50.7 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  48.67 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  49.17 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  45.67 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  47.51 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  39.71 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  42.58 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  38.81 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  41.43 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  34.26 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  38.01 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  37.8 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  35.48 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  38.07 
 
 		 264 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  37.74 
 
 		 252 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  37.32 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  31.4 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  33.88 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  39.66 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  31.88 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  41.74 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  37.93 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  37.82 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  38.79 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  32.39 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  31.94 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  34.86 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  31.94 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  30.47 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  31.94 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  30.82 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  30.82 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  35.59 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  28.83 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  35.34 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  30.56 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  28.83 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  35.34 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  30.82 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  27.35 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  30.7 
 
 		 238 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>