57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0435 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  89.71 
 
 		 323 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  67.65 
 
 		 237 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  53.88 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  56.14 
 
 		 227 aa  251  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  53.74 
 
 		 232 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  54.91 
 
 		 227 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  45.78 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  43.27 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  41.28 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  45.24 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  41.74 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  40.36 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  40.83 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  40.83 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  40.36 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  40.37 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  40.36 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  40.36 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  40.36 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  39.91 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  40.09 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  41.12 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  38.32 
 
 		 233 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  37.33 
 
 		 233 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  38.43 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  37.26 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  37.26 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  32.59 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  37.02 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  36.46 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  38.24 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  28.64 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  30.46 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  36.76 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  29.91 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  31.05 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  29.58 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  33 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  29.08 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  30.96 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  31.92 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  32.49 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  30.53 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  28.03 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  25.11 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  31.72 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  30.46 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  31.18 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  28.51 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  31.18 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  34.56 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  32.39 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  32.46 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  29.7 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  30.5 
 
 		 245 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>