40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1072 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  48.71 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  49.13 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  48.26 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  39.05 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  38.39 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  37.39 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  29.58 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  32.7 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  28.64 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  32.23 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  31.75 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  27.48 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  29.21 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  26.16 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  27.23 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  34.56 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1813  hypothetical protein  39.68 
 
 		 81 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000218616  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  26.46 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  26.96 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  25.6 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  25.24 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  31.62 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  31.62 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  24.27 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  29.85 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  25.13 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  25.6 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  28.89 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  29.85 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  25.6 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  30.6 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  27.41 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  27.41 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  27.41 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  27.36 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  25.6 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  27.33 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  27.41 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  32.17 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>