61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6815 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  100 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  93.13 
 
 		 233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  83.69 
 
 		 233 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  76.39 
 
 		 235 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  75.97 
 
 		 235 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  75.97 
 
 		 235 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  77.09 
 
 		 235 aa  360  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  74.35 
 
 		 231 aa  359  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  73.39 
 
 		 233 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  73.39 
 
 		 233 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  73.39 
 
 		 233 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  73.04 
 
 		 231 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  72.61 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  76.26 
 
 		 233 aa  349  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  66.52 
 
 		 226 aa  308  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  51.89 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  46.92 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  40.45 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  37.09 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  36.62 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  39.72 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  40.83 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  36.99 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  38.32 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  40.28 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  37.38 
 
 		 323 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  40.1 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  35.68 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  36.74 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  36.28 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  34.34 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  34.25 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  38.43 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  38.22 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  33.17 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  32.87 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  35.4 
 
 		 232 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  32.68 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  35.35 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  29.11 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  29.91 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  28.07 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  30.87 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  28.04 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  30 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  39.32 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  27.61 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  31.21 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  35.25 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  29.1 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  24.27 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  37.82 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  37.07 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  35.29 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  38.79 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  31.09 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  32.87 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  30.22 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  27.66 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  35.51 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  29.71 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>