53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0635 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  475  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  81.48 
 
 		 190 aa  322  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  43.6 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  43.53 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  41.74 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  42.2 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  41.28 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  40.09 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  41.74 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  40.09 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  40.09 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  39.91 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  40.83 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  40.37 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  40.37 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  41.2 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  40.91 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  40.91 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  41.36 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  40.89 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  39.53 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  38.43 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  37.9 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  35.38 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  36.11 
 
 		 323 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  35.85 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  35.85 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  34.27 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  33.49 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  34.56 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  32.99 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  33.66 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  36.26 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  31.71 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  29.9 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  32.47 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  27.06 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  29.38 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  31.8 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  26.16 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  30.94 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  32.84 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  32.12 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  32.41 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  30.77 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  27.43 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  31.88 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  27.54 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  30.91 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  31.58 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  24.77 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  29.17 
 
 		 255 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>