49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3924 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  476  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  68.47 
 
 		 233 aa  315  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  45.09 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  40.09 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  37.16 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  35.4 
 
 		 233 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  34.07 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  34.07 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  34.07 
 
 		 235 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  34.07 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  34.51 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  34.26 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  35.57 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  38.24 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  34.5 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  35.2 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  36.63 
 
 		 323 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  31.65 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  31.65 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  34.54 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  31.65 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  34 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  37.16 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  33.51 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  30.73 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  36.22 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  32.97 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  31.94 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  34.1 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  35.68 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  30.77 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  32.66 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  31.34 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  32.43 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  30.88 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  29.96 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  32.47 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  35.09 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5839  hypothetical protein  33.85 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  23.2 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  27.75 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  30.77 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  28.87 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  25.79 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  32.54 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  30.83 
 
 		 243 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>