47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0270 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  99.55 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  77.83 
 
 		 221 aa  354  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  64.22 
 
 		 231 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  63.64 
 
 		 223 aa  284  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  61.01 
 
 		 223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  39.29 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  33.8 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  30.4 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  37.07 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  32.68 
 
 		 233 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  36.59 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  34.34 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  34.85 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  34.34 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  33.84 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  34.34 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  32.99 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  32.14 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  31.12 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  31.12 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  32.68 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  32.2 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  34.78 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  36.41 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  32.2 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  32.2 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  32.2 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  32.68 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  31.71 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  31.71 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  34.85 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  32.83 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  32.97 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  29.95 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  29.7 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  28.06 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  29.38 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  26.98 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  22.87 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  28.87 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  22.86 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  23.24 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  27.64 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  26.85 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>