48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4483 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  42.92 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  40.09 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  36.73 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  36.45 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  35 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  35.27 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  34.78 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  33.17 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  31.92 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  34.65 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  31.6 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  31.6 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  34.12 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  29.25 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  30.19 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  30.19 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  30.37 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  30.66 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  30.19 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  30.19 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  30.66 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  30.66 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  30.19 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  30.24 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  29.91 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  31.91 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  29.72 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  32.56 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  28.16 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  27.67 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  31.92 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  32.08 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  27.43 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  26.96 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  30.19 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  30.09 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  28.89 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  31.03 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  26.48 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  26.48 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  27.85 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  28.78 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5839  hypothetical protein  29.5 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  27.54 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  30 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  25.64 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  28 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>