20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_32410 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  364  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  73.21 
 
 
174 aa  235  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  51.32 
 
 
159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  48.1 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  44.3 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  43.71 
 
 
175 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  34.78 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  31.74 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  34.57 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  33.13 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  31.71 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  33.12 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  32.92 
 
 
165 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  32.52 
 
 
168 aa  57.8  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  28 
 
 
226 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  33.33 
 
 
158 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  29.41 
 
 
157 aa  40.8  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>