28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4974 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  100 
 
 
168 aa  339  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  82.32 
 
 
180 aa  286  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  75.15 
 
 
165 aa  261  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  65.43 
 
 
173 aa  228  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  41.82 
 
 
172 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  36.22 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  37.06 
 
 
181 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  33.75 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  30.99 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  34.25 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  32.52 
 
 
178 aa  57.8  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  31.01 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  44.26 
 
 
157 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  46.81 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  25.17 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  44.68 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  27.14 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  27.86 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  37.66 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  25.52 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  32.53 
 
 
174 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  27.59 
 
 
153 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  31.18 
 
 
3159 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  44.68 
 
 
152 aa  40.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  44.68 
 
 
152 aa  40.8  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  44.68 
 
 
152 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4540  hypothetical protein  27.56 
 
 
189 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>