78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1792 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  313  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  313  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  99.34 
 
 		 152 aa  312  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  45.39 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  43.71 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  45.39 
 
 		 153 aa  150  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  44.37 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  37.01 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  40.52 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  33.77 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  40.26 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  37.13 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  37.13 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  38.06 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  37.42 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  35.95 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  38.64 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  36.42 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  37.58 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  37.58 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  35.71 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  35.48 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  35.12 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  35.71 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  38.57 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  33.99 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  36.57 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  36.77 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  32.05 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  36.69 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  33.33 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  35.26 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  35.9 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  39.32 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  39.32 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  34.09 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  38.46 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  38.46 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  38.46 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  38.46 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  33.09 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  32.28 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  30.07 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  36.75 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  35.95 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  32.84 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  32.89 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  34.59 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  27.81 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  33.58 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  34.07 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  32.33 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  32.48 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  31.34 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  31.79 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  35.29 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  31.37 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  31.01 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  32.85 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  32.85 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  32.85 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  28.95 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  31.82 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0727  hypothetical protein  40.58 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  28.79 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  31.71 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  29.66 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3122  hypothetical protein  29.66 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7385  RES domain-containing protein  27.39 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285549 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  28.78 
 
 		 173 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  28.67 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  44.68 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4540  hypothetical protein  37.5 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  27.21 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  38.33 
 
 		 180 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>