69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5424 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  81.76 
 
 		 160 aa  280  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  81.76 
 
 		 160 aa  280  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  58.49 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  54.78 
 
 		 160 aa  192  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  40.82 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  41.89 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  43.62 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  39.07 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  39.86 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  32.89 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  36.96 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  36.23 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  32.34 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  32.85 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  32.34 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  33.08 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  31.85 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  31.74 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  33.78 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  31.17 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  32.03 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  32.21 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  31.62 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  32.03 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  32.03 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  33.33 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  30.07 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  30.07 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  30.07 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  29.85 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  31.21 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  28.28 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  28.46 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  28 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  33.06 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  33.8 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  28.76 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  26.57 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  26.57 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  27.97 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  33.91 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  29.85 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  31.01 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  32.21 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  29.03 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  24.63 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  34.62 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  31.71 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  31.71 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  27.74 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  31.71 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  24.83 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  25.83 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  27.66 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  25.93 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  27.27 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7385  RES domain-containing protein  34.59 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  26.71 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  26.76 
 
 		 157 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  30 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  26.81 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  26.92 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  26.62 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>