71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2079 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  96.55 
 
 		 145 aa  289  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  95.86 
 
 		 145 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  74.31 
 
 		 145 aa  213  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  47.41 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  47.41 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  43.54 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  43.54 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  43.54 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  44.03 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  42.18 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  42.18 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  41.5 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  40.52 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  37.58 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  36.94 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  38.82 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  38.71 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  39.35 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  34.78 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  38.85 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  38.31 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  33.33 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  39.29 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  39.35 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  34.48 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  35.48 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  37.14 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  32.62 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  33.55 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  34.59 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  35.48 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  36.5 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  31.88 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  37.32 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  32.08 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  33.76 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  35.21 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  35.97 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  32.74 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  32.74 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  33.81 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  34.44 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  34.44 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  34.65 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  34.09 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  33.11 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  33.58 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  31.21 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  32.85 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  32.85 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  29.79 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  32.05 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  32.74 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  32.91 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  32.85 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  34.53 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  27.74 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  32.7 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  33.09 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  32.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  28.67 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  34.48 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  28.76 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  34.48 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  35.19 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  27.86 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  25.56 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3122  hypothetical protein  31.29 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  27.1 
 
 		 168 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>