71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1397 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  294  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  71.23 
 
 		 148 aa  214  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  53.74 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  53.74 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  53.74 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  53.06 
 
 		 159 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  51.7 
 
 		 159 aa  147  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  52.38 
 
 		 158 aa  146  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  50.34 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  45.95 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  48.89 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  48.89 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  47.41 
 
 		 145 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  40 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  37.42 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  37.91 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  38.26 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  36.5 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  36.67 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  37.91 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  38.31 
 
 		 165 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  31.43 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  36.13 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  36.77 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  37.25 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  33.12 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  39.13 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  33.99 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  35.9 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  35.26 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  38.85 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  36.5 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  36 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  33.97 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  35.16 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  32.14 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  33.97 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  36.96 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  35.16 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  32.03 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  34.67 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  36.15 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  31.62 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  30.95 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  31.62 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  30.95 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  31.62 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  32.03 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  32.67 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  36.36 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  33.63 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  34.44 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  31.62 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  29.93 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  30.38 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  29.03 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  35.48 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  35.14 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  32.64 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  29.01 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  25.58 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  28.87 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  30 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4771  RES domain-containing protein  32.17 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  33.33 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  28.95 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  34.33 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  29.08 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  26.92 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7385  RES domain-containing protein  28.45 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>