68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5026 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  313  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  56.38 
 
 
165 aa  164  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  53.02 
 
 
161 aa  152  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  49.01 
 
 
159 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  42.96 
 
 
157 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  41.01 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  33.57 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  41.06 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  45.05 
 
 
117 aa  91.3  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  37.09 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  39.29 
 
 
152 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  38.57 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  38.57 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  35.53 
 
 
157 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  39.13 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  35.37 
 
 
152 aa  85.1  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  33.77 
 
 
149 aa  84  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  37.01 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  38.13 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  34.75 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  36.43 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  39.16 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  36.88 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  38.06 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  39.16 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  36.3 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  39.29 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  35.07 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  32.43 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  35.34 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  33.55 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  33.55 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  33.57 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  38.16 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  36.3 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  34.59 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  37.01 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  35.9 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  35.9 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  35.9 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  36.22 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  34.62 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  34.56 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  36.62 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  32.17 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  31.21 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  35.06 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  31.58 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  35.9 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  34.42 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  32.24 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  30.88 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  34.97 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  33.56 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  31.45 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  33.33 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  33.58 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  29.87 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  30.15 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  30.26 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  34.48 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  32.65 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  30.23 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  34.27 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  33.03 
 
 
153 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  33.06 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>