72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4184 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  71.23 
 
 		 149 aa  214  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  57.82 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  57.82 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  57.82 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  57.14 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  57.14 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  55.1 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  53.06 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  48.65 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  48.55 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  48.55 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  47.41 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  42 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  38.99 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  40.52 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  41.56 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  34.29 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  36.3 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  38.26 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  33.99 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  36.88 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  35.29 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  36.6 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  37.09 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  36.36 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  36.77 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  36.42 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  32.86 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  38.69 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  35.26 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  33.86 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  36.3 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  32.05 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  37.5 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  32.68 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  37.23 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  34.52 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  33.09 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  33.09 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  33.09 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  37.98 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  35.33 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  33.77 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  32.05 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  32.05 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  38.22 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  38.03 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  35.06 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  33.63 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  32.74 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  32.74 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  34.53 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  32.03 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  34.62 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  28.47 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  31.79 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  33.79 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  35.1 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  26.56 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  35.51 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  28.48 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  36.57 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  27.01 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  28.99 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  33.33 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7385  RES domain-containing protein  28.24 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  28.37 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  27.94 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4771  RES domain-containing protein  30.43 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0727  hypothetical protein  40.28 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>